Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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