Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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