Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
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