Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms