Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
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GRIN2AQ12879 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
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GRIN2AQ12879 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
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