Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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