Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms