Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms