Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms