Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms