Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms