Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN1Q04323 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms