Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DSG1Q02413 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DSG1Q02413 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DSG1Q02413 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DSG1Q02413 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DSG1Q02413 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSG1Q02413 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DSG1Q02413 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DSG1Q02413 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSG1Q02413 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DSG1Q02413 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DSG1Q02413 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSG1Q02413 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DSG1Q02413 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DSG1Q02413 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DSG1Q02413 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DSG1Q02413 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DSG1Q02413 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSG1Q02413 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DSG1Q02413 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSG1Q02413 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSG1Q02413 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSG1Q02413 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms