Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms