Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms