Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms