Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms