Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSG4Q00888 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSG4Q00888 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms