Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms