Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms