Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTNAP1P78357 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms