Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS28P62857 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS28P62857 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS28P62857 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS28P62857 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS28P62857 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS28P62857 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS28P62857 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS28P62857 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS28P62857 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS28P62857 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS28P62857 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS28P62857 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS28P62857 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS28P62857 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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