Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL23P62829 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL23P62829 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL23P62829 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL23P62829 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL23P62829 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL23P62829 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL23P62829 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL23P62829 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL23P62829 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL23P62829 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL23P62829 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL23P62829 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms