Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms