Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms