Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms