Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VBP1P61758 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VBP1P61758 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VBP1P61758 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
VBP1P61758 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VBP1P61758 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VBP1P61758 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VBP1P61758 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VBP1P61758 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VBP1P61758 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VBP1P61758 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VBP1P61758 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VBP1P61758 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VBP1P61758 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VBP1P61758 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VBP1P61758 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VBP1P61758 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VBP1P61758 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms