Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms