Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms