Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3AP57075 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms