Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms