Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms