Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPTEP56180 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPTEP56180 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPTEP56180 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPTEP56180 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPTEP56180 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPTEP56180 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TPTEP56180 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms