Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX9P55771 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX9P55771 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms