Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFDNP55196 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFDNP55196 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFDNP55196 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFDNP55196 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFDNP55196 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFDNP55196 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AFDNP55196 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFDNP55196 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFDNP55196 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFDNP55196 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFDNP55196 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFDNP55196 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFDNP55196 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFDNP55196 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AFDNP55196 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFDNP55196 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFDNP55196 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AFDNP55196 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFDNP55196 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFDNP55196 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFDNP55196 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFDNP55196 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFDNP55196 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFDNP55196 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFDNP55196 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFDNP55196 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFDNP55196 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFDNP55196 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFDNP55196 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFDNP55196 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFDNP55196 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFDNP55196 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFDNP55196 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFDNP55196 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFDNP55196 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AFDNP55196 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AFDNP55196 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AFDNP55196 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFDNP55196 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFDNP55196 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFDNP55196 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFDNP55196 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFDNP55196 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFDNP55196 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFDNP55196 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFDNP55196 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFDNP55196 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFDNP55196 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFDNP55196 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFDNP55196 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFDNP55196 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFDNP55196 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFDNP55196 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFDNP55196 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFDNP55196 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFDNP55196 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFDNP55196 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFDNP55196 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFDNP55196 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFDNP55196 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFDNP55196 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFDNP55196 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFDNP55196 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFDNP55196 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFDNP55196 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFDNP55196 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms