Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms