Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms