Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-5P52952 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms