Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK4P51957 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK4P51957 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK4P51957 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK4P51957 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK4P51957 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK4P51957 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK4P51957 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK4P51957 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK4P51957 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK4P51957 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK4P51957 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK4P51957 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK4P51957 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK4P51957 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK4P51957 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK4P51957 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEK4P51957 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEK4P51957 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK4P51957 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK4P51957 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK4P51957 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK4P51957 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK4P51957 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK4P51957 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK4P51957 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK4P51957 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK4P51957 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK4P51957 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK4P51957 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK4P51957 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK4P51957 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK4P51957 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK4P51957 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK4P51957 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK4P51957 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK4P51957 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK4P51957 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK4P51957 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK4P51957 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK4P51957 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK4P51957 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK4P51957 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK4P51957 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK4P51957 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK4P51957 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK4P51957 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK4P51957 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK4P51957 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK4P51957 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK4P51957 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK4P51957 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK4P51957 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK4P51957 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK4P51957 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK4P51957 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK4P51957 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK4P51957 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK4P51957 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK4P51957 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK4P51957 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms