Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SMARCA4P51532 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA4P51532 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms