Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms