Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRE11P49959 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRE11P49959 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRE11P49959 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRE11P49959 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms