Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms