Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTBP49356 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FNTBP49356 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FNTBP49356 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms