Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTTP42858 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HTTP42858 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTTP42858 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTTP42858 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTTP42858 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTTP42858 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTTP42858 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTTP42858 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTTP42858 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTTP42858 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTTP42858 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTTP42858 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTTP42858 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTTP42858 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTTP42858 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTTP42858 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTTP42858 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTTP42858 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTTP42858 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTTP42858 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTTP42858 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTTP42858 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HTTP42858 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HTTP42858 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTTP42858 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTTP42858 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTTP42858 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTTP42858 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTTP42858 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTTP42858 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTTP42858 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTTP42858 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTTP42858 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTTP42858 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTTP42858 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTTP42858 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTTP42858 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTTP42858 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTTP42858 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTTP42858 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTTP42858 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTTP42858 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTTP42858 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms