Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GGCXP38435 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GGCXP38435 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GGCXP38435 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GGCXP38435 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GGCXP38435 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GGCXP38435 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGCXP38435 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGCXP38435 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGCXP38435 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms