Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN7P35236 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms