Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms