Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms