Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4AP27815 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms